Wanneer Noah en zijn zusje Emma een vreemde doos openen die ze op het strand vonden, ontdekken ze enkele spulletjes en een peluchen konijn dat door Emma "Mimzy" wordt gedoopt. Waar komen deze voorwerpen vandaan en waarvoor dienen ze? Wat later beginnen de twee kinderen bovennatuurlijke krachten te ontwikkelen. De interesse van het FBI en een aantal wetenschappers is gewekt. Emma en Noah zullen hun schat moeten beschermen, want de toekomst van mensheid staat op het spel en Mimzy is er de sleutel van...