Archief - NASA: Ontdekking nieuwe levensvorm

Leven is uiteindelijk maar een chemische reactie die zichzelf in stand houdt, met een beetje kansberekening kan men inzien dat zo'n actie en reactie zich feitelijk bijna overal kan voordoen.

Even nuanceren: de bacterie groeit in laboratoriumomstandigheden bij voorkeur nog altijd op fosfor. Het is maar wanneer er geen fosfor aanwezig is, dat ze overschakelt op arseen.

Evenzeer een geweldig interessante ontdekking. Zelfs de fosfaatgroepen uit de DNA-ruggengraat en ATP moleculen zouden vervangen worden door arsenaat. Voor eender welke andere (bekende) levensvorm op aarde zou dat drastische gevolgen hebben voor de biochemie van de cel, deze bacterie heeft er blijkbaar niet veel last van.

Als daadwerkelijk alle fosfaatgroepen in het DNA vervangen zouden worden kan je eigengelijk niet meer van 'DNA' spreken. En in hetzelfde geval al helemaal niet meer van ATP.

Youthmode zei:

Even nuanceren: de bacterie groeit in laboratoriumomstandigheden bij voorkeur nog altijd op fosfor. Het is maar wanneer er geen fosfor aanwezig is, dat ze overschakelt op arseen.

Evenzeer een geweldig interessante ontdekking. Zelfs de fosfaatgroepen uit de DNA-ruggengraat en ATP moleculen zouden vervangen worden door arsenaat. Voor eender welke andere (bekende) levensvorm op aarde zou dat drastische gevolgen hebben voor de biochemie van de cel, deze bacterie heeft er blijkbaar niet veel last van.

Klik om te vergroten...

eigenlijk had ik al een vermoeden dat er in het universum beesten op andere stoffen leefden dan wij, gelijk in die film evolution, waar die beesten met shampoo kunnen gekilled worden

Youthmode zei:

Als daadwerkelijk alle fosfaatgroepen in het DNA vervangen zouden worden kan je eigengelijk niet meer van 'DNA' spreken. En in hetzelfde geval al helemaal niet meer van ATP.

Klik om te vergroten...

Dat is wat hij zei. ATP is een naam van een molecule. Niemand gaat iets fosfaat noemen als er geen fosfaat meer in zit... ATA dus.

oogje in het zeil houden op wikileaks, ze hebben bericht gegeven binnenkort geheime documenten ivm UFO's en dergelijke online te zetten
ook zouden er nog documenten online komen van cable gate met verwijzingen naar UFO's

blijkbaar hebben ze nog wat levensvormen gevonden op de WC bril van het ISS

Ondertussen is er al heel wat kritiek gekomen op de publicatie.

The big problem, however, is that the authors have shown that the organism takes up arsenic, but they "haven't unambiguously identified any arsenic-containing organic compounds", says Roger Summons, a biogeochemist at the Massachusetts Institute of Technology in Cambridge. "And it's not difficult to do," he adds, noting that the team could have directly confirmed or disproved the presence of arsenic in the DNA or RNA using targeted mass spectrometry.

Klik om te vergroten...

Microbe gets toxic response : Nature News

Wordt ongetwijfeld vervolgd

Ik snap het ook niet goed. Als je dit zo leest dan zijn ze precies toch wel heel slordig te werk gegaan. :/

Hier nog een interessant artikel dat ook enkele blunders en onvoorzichtigheden bloot legt.
Blog - Rosie Redfield

Volgens mij hebben ze wat te vroeg gesproken en zal het idd nog even afwachten zijn op een definitief antwoord. Wel echt bizar dat ze dan in hun persconferentie zulke zware claims de wereld hebben ingestuurd. Van de NASA zou je toch nog net dat ietsje meer verwachten.

Als je de paper hebt gelezen merk je ook dat er heel veel zaken op die persconferentie zijn gezegd die in feite helemaal niet in die paper zijn terug te vinden. Zo heeft Wolfe het bijvoorbeeld over arseen dat fosfaat als element in het DNA vervangt. Ze laat daar zelfs een kort filmpje van zien.

Dit staat in contrast met haar eigen conclusie in de paper: "How arsenic insinuates itself into the structure of biomolecules is unclear, and the mechanisms by which such molecules operate are unkown". Wat overblijft is niets meer dan een organisme dat kan overleven in een extreme biotoop. In feite voeg je dus een organisme toe aan een hele waslijst van extremofielen. En dat is op zich helemaal niet bijzonder.

Bovendien zijn de technieken die Wolfe hanteert (om arseen te bepalen) grotendeels indirect, en maakt ze gebruik van extractiemethoden die helemaal niet zijn bewezen te werken bij dergelijke structuren. In de paper worden die technieken of het gebruik ervan zelfs niet in vraag gesteld.

Er zijn andere methoden om te bepalen of het hier wel degelijk gaat om de incorporatie van arseen in het DNA. Die zou ze dan ook beter aanspreken in haar tweede paper waar ze momenteel aan schrijft. Het is misschien ook daarom dat ze zo zeker is van haar zaak. Zij weet (hopelijk) een aantal dingen die nog niet zijn gepubliceerd.

Crystallografie zal wel uitsluitsel brengen en misschien is dat wat in haar tweede paper staat.

X-ray fiber diffraction om precies te zijn. Werd ook in de jaren '50 door Franklin gebruikt om de DNA-structuur te beschrijven en zou hier 100% uitsluitsel geven. Het is op z'n minst vreemd te noemen dat dit niet in haar eerste paper is gebeurd.

Extraordinary claims require extraordinary evidence!

ALS ze dergelijke biomoleculen al kunnen detecteren moet ook nog aangetoond kunnen worden dat deze net als hun fosfor-equivalenten ook functioneel/actief zijn in de biochemie van de cel. Met andere woorden dat ze de volwaardige vervangers zijn van ATP,DNA,fosfolipidemembranen et cetera. Bijvoorbeeld dat de membranen even sterk zijn en dat proteïnen even effectief geactiveerd worden door arseen-binding. En welke andere veranderingen het organisme daarvoor heeft moeten ondergaan.

Als dat niet zo is heb je volgens mij gewoon een organisme dat in staat is onder enorme arseen-stress te overleven.

Wat betreft de technieken: dit vind ik op de website van Nature:

When the researchers added radio-labelled arsenate to the solution to track its distribution, they found that arsenic was present in the cellular fractions containing the bacterium's proteins, lipids and metabolites such as ATP and glucose, as well as in the nucleic acids that made up its DNA and RNA. The amounts of arsenate detected were similar to those expected of phosphate in normal cell biochemistry, suggesting that the compound was being used in the same way by the cell.

The team used two different mass-spectrometry techniques to confirm that the bacterium's DNA contained arsenic, implying — although not directly proving —that the element had taken on phosphate's role in holding together the DNA backbone. Analysis with laser-like X-rays from a synchrotron particle accelerator indicated that this arsenic took the form of arsenate, and made bonds with carbon and oxygen in much the same way as phosphate.

Klik om te vergroten...

Cin zei:

X-ray fiber diffraction om precies te zijn. Werd ook in de jaren '50 door Franklin gebruikt om de DNA-structuur te beschrijven en zou hier 100% uitsluitsel geven. Het is op z'n minst vreemd te noemen dat dit niet in haar eerste paper is gebeurd.

Extraordinary claims require extraordinary evidence!

Klik om te vergroten...

Die kristallen zijn niet makkelijk te maken en misschien dat het arsenicum het lastiger maakt. Voor kristallografie moet je sample heel zuiver zijn en de mindere stabiliteit van het DNA met arsenicum in plaats van fosfor is minder stabiel.

Ik ben geen biochemicus maar ik denk dat je gelijk hebt. Ik heb Wolfe al horen zeggen dat arsenicum minder sterk bindt als fosfaat.

Edit: vooral in water is de binding erg instabiel.

J3rry zei:

oogje in het zeil houden op wikileaks, ze hebben bericht gegeven binnenkort geheime documenten ivm UFO's en dergelijke online te zetten
ook zouden er nog documenten online komen van cable gate met verwijzingen naar UFO's

blijkbaar hebben ze nog wat levensvormen gevonden op de WC bril van het ISS

Klik om te vergroten...

Awel, dat zijn toch zeker leaks waar ik op zit te wachten!